Restauración
Las pinturas han sufrido mucho por el clima húmedo y variable de la Llanada Alavesa. Por el cambio del gusto estético, con la llegada del barroco, desaparecieron tras una capa de cal y quedaron escondidas detrás del retablo.
El descubrimiento de las pinturas se hizo en 1967. La Diputación Foral de Álava restauró el conjunto a cargo del arquitecto provincial don Jesús Guinea. Los albañiles encargados de raspar la capa de cal destrozaron algunas partes: en el intradós del arco arrancaron parte del mortero, desapareciendo también parte de las figuras.
La restauración de las pinturas la realizó un instituto madrileño especializado entre 1969-70. Se saneó el muro, limpió las pinturas, eliminó las eflorescencias salinas y cálcicas y los parásitos y se consolidó el muro y las pinturas, tratando las lagunas y el color y previniendo contra nuevos parásitos.
Su objetivo era, respetando lo descubierto, devolver al conjunto su carácter estético y visible. Por eso los restauradores aclararon algunas formas y siluetas casi borradas.
La humedad en los cimientos del casco del ábside era un gran problema, ya que producía una condensación en el interior por ser un edificio mal ventilado. Además, la cola animal empleada en la restauración se desnaturalizaba y ponía en peligro toda la pintura. Se hicieron ensayos para secar la pared absidal, practicando orificios exteriores y poniendo tubos en la parte de afuera de la pared, sin ningún éxito.
Finalmente, se instalaron en la base del muro del ábdide placas de hormigón colocadas bajo los cimientos, que impiden la subida de la humedad. Y en el interior del muro del ábside se colocó una capa de aislante. El revestimiento exterior se renovó con piedras de la iglesia derruida de Galarreta, eliminando así los problemas de humedad.
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